Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms