Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC11O43248 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms