Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF1O43189 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF1O43189 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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