Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms