Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms