Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP9YO00507 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP9YO00507 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms