Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM5B3KS81 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms