Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRR3A8MPY1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRR3A8MPY1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms