Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PIPSLA2A3N6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms