Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms