Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVW-1Q9UQF0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms