Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGSF9BQ9UPX0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms