Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGTPBP1Q9UPW5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms