Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF8Q9UPP1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms