Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TTF2Q9UNY4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms