Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNRF3Q9ULT6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms