Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMKLBQ9ULI2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms