Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB23Q9ULC3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms