Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIMS3Q9UJD0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms