Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHORDC1Q9UHD1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms