Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MLH3Q9UHC1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH3Q9UHC1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms