Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms