Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C6orf48Q9UBA6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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