Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CC2D2AQ9P2K1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CC2D2AQ9P2K1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms