Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRBP1Q9P2E9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRBP1Q9P2E9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms