Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP36Q9P275 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms