Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATAD3AQ9NVI7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms