Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG3Q9NT62 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms