Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms