Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms