Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms