Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BBS2Q9BXC9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms