Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLVAPQ9BX97 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLVAPQ9BX97 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms