Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL2Q99962 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms