Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms