Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms