Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPR78Q96P69 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms