Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms