Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNBD2Q96M20 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms