Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms