Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MVB12AQ96EY5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms