Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIRT1Q96EB6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms