Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms