Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms