Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX13Q92968 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX13Q92968 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms