Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKL3Q8IVW4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms