Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms