Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q71RC1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms