Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP31Q70CQ4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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USP31Q70CQ4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP31Q70CQ4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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