Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms